科室拥有市内一流的消化内镜下诊疗技术水平，是吉安市医学会消化内科及消化内镜主任委员挂靠单位，吉安市消化及消化内镜质控中心挂靠单位，现有医师22人，护士9人，主任医师5人，副主任医师4人，为吉安市培养了大批的消化内镜专业技术人员。

目前南北院区共有高清内镜主机8台，放大内镜1台，小肠镜1台，超声内镜1台，爱尔博等高频电刀6台，6间内镜诊疗室。年消化内镜诊疗病例2万余人次，其中治疗内镜2000余例。科室熟练开展急性上消化道出血内镜下诊治、消化道肿瘤内镜下切除、胆总管结石内镜下取石、食管曲张静脉和痔疮套扎术等技术，科室还开设绿色通道，涵盖急性消化道出血、消化道异物等多种急诊内镜治疗和术中、床旁诊疗。